You can also look at: https://satijalab.org/seurat/
五大R包，唯Seurat独尊
大家需要熟练掌握5个R包，分别是: scater,monocle,Seurat,scran,M3Drop
step1: 创建对象
step2: 质量控制QC
step3: 表达量的标准化和归一化
step4: 去除干扰因素(多个样本整合)
step5: 判断重要的基因
step6: 多种降维算法
step7: 可视化降维结果
step8: 多种聚类算法
step9: 聚类后找每个细胞亚群的标志基因
step10: 继续分类（case-study）
降维：
https://holab-hku.github.io/Fundamental-scRNA/
聚类与细胞注释：
https://github.com/pkuerten/single_cell_clustering_annotation.github.io/blob/main/index.md
读入数据的后缀类型：
（1）.h5文件(所以需要hf5r的R包)
e.g. https://github.com/holab-hku/Fundamental-scRNA/blob/master/data/10k_PBMC.h5