-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 27
/
Copy pathhla2paratopeTable_aligned.txt
63 lines (63 loc) · 3.52 KB
/
hla2paratopeTable_aligned.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
HLA pseudo
HLA-A*0203 ------------YYEKVAH---TVDTLYRY-YYTKWEQWYTWY---
HLA-A*0205 ------Y-----YYEKVV---------YDYYRDTKWQWYWY-----
HLA-A*0206 -----MY-----YYEKVAH---TVDTLYRYHYYTKWVQLYTWY---
HLA-A*0207 ------M-----YYEKVAH---TVDTLYR-HYYTKWVQLYTWY---
HLA-A*3001 ------M-----YYENV-QT-----DTLYIYHYTKWWQLYWY----
HLA-A*6801 -----MY-----YYRNNAQT---V--DTLYYDYTKWAVQWYTWY--
HLA-A*9235 ------M-----YYEKV-HT-----DTYRYHYYTKWVQLYWY----
HLA-A*9253 ------M-----YYEKHT---------VDTRYYTKWYTWY------
HLA-B*0602 ----YDS------YEKYRQ-------ANKYWYYTKWEQWYWY----
HLA-B*1557 ---------------YQWN-----TLYRYEFYWTKWAAYW------
HLA-B*1801 ------Y----HSYRNITNTYES-NLYLR-YSYTKWVQYTW-----
HLA-B*3505 -------------YSGFYNDMNH-NSYPG-----------------
HLA-B*4001 ---MYHT-----KYREITNT-ESNY-----RYYSKVQYWY------
HLA-B*4002 ---MYHT----FKYREISNTYES-NLYLSYYYITKWVQLYEWY---
HLA-B*4044 ---MYHT----FKYREISNTYES-NLYLSYYYITKWVQLYEWY---
HLA-B*4102 ----YHT-----KYREIT---ESNL---YLYYYTKWQDYWY-----
HLA-B*4104 ---MYHT-----KYREISNT-ESNL---YLYYYTKWAVQDYTWY--
HLA-B*4202 ------------YYRNIYAQTES-NLYL--YYYTKWAVQDYWY---
HLA-B*4601 -----------MYYREKY-QTVS-NLY---RYYTKWEQWYLWY---
HLA-B*5706 ------M-----YYENSTNI---------YIYYIKWQLYWY-----
HLA-B*5712 ------M-----YYENMTYN------NYIYDYWTKWQLYWY-----
HLA-B*8103 -----------YYYRNIYAQTES-NYY---NYYSKVQDYEWY----
HLA-B*9234 ------------MYEKH--T-----DTLYRYYYTKWVQYTWY----
HLA-C*0102 -----------YHYRES--ATIF-NT-YWHFYWSKSEHQYWY----
HLA-C*0304 ------M-----YREKRQT-----SNLY--RYYYTWEQYWY-----
HLA-C*0401 ------Y-----YREKYRQD----NKLYLRFFYTKWRYWY------
HLA-C*0517 ------M-----YYEKRQT-----NKLYRYNFYTKWERYWY-----
HLA-C*0602 MYDSYEK------YRQADV-------NKLYWYYTKWQWYWY-----
HLA-C*0756 -----YD----FSYREKY-QAVS-NLYR--SDYTKLAQLYTWY---
HLA-C*1604 -----------YYYRNIFNTYES-NLY---RYYTKWQLYLWY----
HLA-A*0101 ------M-----YYQENTHT---NTLYIIYRDYTKWAQRYYRGRY-
HLA-A*0201 ---MYMM-----YYEKVVHHTHTVDTLYRYYYYTKWVQLYYYYY--
HLA-A*0224 ----MYM-----YYEKH-HT----DTLYRYYYYTKWVQLYWY----
HLA-A*0301 -----MY-----YQENVVAQ------DTYYRDYTKWEQLYTWY---
HLA-A*0362 ------M-----YYENA-QT-----DTLYYRDYTKWEQLYWY----
HLA-A*1101 ------Y-----YYENAQV---TVDTLYYYRDYTKWAAQQYWY---
HLA-A*2301 ------------YYEKVAHT------NIYLFYYTKWVQQYTGY---
HLA-A*2402 ------M-----YYEKKVHT----NIYLMFHYYTKWVQYYTYRY--
HLA-A*3003 ----YSM-----YYENVHTE----NTLYIYEHYTKWRLYTWY----
HLA-A*9234 ------------MYEKV-HT----HDT-YRYYYTKWVLLYWY----
HLA-B*0702 -----------YYYRNIY-QTES-NLYYY-DYYTKWEQRYEWY---
HLA-B*0801 ---MYDY----YFYRNIFNTDES-NLYLSYNYYTKWVVQDYWYY--
HLA-B*1402 ---YYSY----YSEYNICTNTES-NLYLW-YFYTKWELYTW-----
HLA-B*1501 MYYAMYY----YYREI--NTYES-NLYLRYSYYTKWAEQWYLWY--
HLA-B*2703 ----YHT-----EHREICTE-D---TLY-LYDYTKWVQLYEWY---
HLA-B*2705 ---YYHT----EYREEICTE-DEDTLYL-YYDYTKWVQLAYEWY--
HLA-B*2709 ---MYHT----EYREQICTE-TDDTY---YYHYTKWVVQLYEWY--
HLA-B*2713 ---MYHTEVVRFYREEICAK-DTDYYYHYHDAYTKWVRQLYYECWY
HLA-B*3501 -----MM----YYRNIFTNTYES-NLYIRYSSYTKWAVQLYWY---
HLA-B*3508 ----MMY----YYRQIITNTYES-NLYIR-YSYTKWQRWYYWY---
HLA-B*3901 -----YY----YSEYNIC-TTES-NLYLR-YFYTKWVQYYWY----
HLA-B*4201 ------------YYRNIYAQTES-NY-L--YYYTKWAVQDYWY---
HLA-B*4402 ---MYYT-----KYREISNT-ENNTT--YIYDYTKWVVQDYLSRY-
HLA-B*4403 ---MYYT-----KYREITTE---NTY--IRYDYTKWVVQLYLSRY-
HLA-B*4405 ---MYYT-----KYREITTE---NTY--I-YYYTKWVVQDYLSRY-
HLA-B*5101 ------Y-----YYRNINT------YNIYWYYYTKWEQLYLW----
HLA-B*5301 ------Y-----YYRNIFT----NTENIYIRYYTKWVQLYWY----
HLA-B*5701 ------M-----YYENTYNI------YIYDSYWTKWVQLYWY----
HLA-B*5703 ----MYY-----YEENA-ST----NTYNIYYYYTKWVQLYWYY---
HLA-B*5801 ------------YYENSTYE---NIYIRYSAYYTKWVQLYWYY---
HLA-B*8102 ------M----YYYRNIYAQTES-NLYY--NYYSKAVQLYWY----
HLA-C*1510 -----MY-----YYENMQTD---DNIYIYIYDYTKWVQLYLWY---