PHPでは、anyenv のディレクトリ下に相変わらず php.ini が存在します。 処理系の動作に設定ファイルがあるのは、控えめに言って地獄 なのは嫌というほど知っているでしょう。 (まず弄ることがないとしても)
また、PHPのパッケージシステムといえば composer ですが、このインストール方法が本当にひどく、phpenvの世界ではどうするべきかまだデファクトがなさそうです1。
PHPに関しては環境構築がそれほど簡単ではないと言えるでしょう。
Footnotes
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ngyuki/phpenv-composerというプラグインがあったけどStarが15でメジャーではなさそう ↩