Skip to content

Commit d0352b6

Browse files
sigvensigven
committed
add example files
1 parent e2ff6e1 commit d0352b6

12 files changed

+258669
-1
lines changed

Diff for: ‎examples/T001-BRCA.cna.tsv

+261
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -0,0 +1,261 @@
1+
Chromosome Start End nMajor nMinor
2+
1 809641 37651942 1 0
3+
1 37652105 39719316 1 1
4+
1 39720284 39730945 1 0
5+
1 39731576 58117307 1 1
6+
1 58119861 74123233 1 0
7+
1 74125417 74249893 2 0
8+
1 74253177 108354137 1 0
9+
1 108360985 114295841 2 1
10+
1 114296058 114426978 1 1
11+
1 114430211 116197573 23 1
12+
1 116197921 120179960 6 1
13+
1 120345914 121601104 3 0
14+
1 121602702 125122318 2 0
15+
1 144548471 165650475 1 1
16+
1 165652366 165699056 2 1
17+
1 165701411 244939201 1 1
18+
1 244939564 245242991 2 1
19+
1 245248538 248916508 1 1
20+
2 12091 14311681 1 1
21+
2 14324312 40825404 1 0
22+
2 40825621 46733190 2 1
23+
2 46735600 65335836 1 1
24+
2 65340178 65429907 1 0
25+
2 65434334 106849116 1 1
26+
2 106849451 106884471 1 0
27+
2 106887940 142433173 1 1
28+
2 142434719 178785144 1 0
29+
2 178785974 217287388 1 1
30+
2 217289319 227369585 2 1
31+
2 227372367 227889340 1 1
32+
2 227892604 242109969 1 0
33+
3 12690 1033144 2 1
34+
3 1033342 21546098 2 0
35+
3 21547161 85648464 1 0
36+
3 85649515 86316676 1 1
37+
3 86323084 91516125 1 0
38+
3 93753967 99553723 2 1
39+
3 99554551 104123230 2 0
40+
3 104124406 104363332 0 0
41+
3 104367681 124028941 2 0
42+
3 124037457 127113544 3 0
43+
3 127116281 165545506 2 0
44+
3 165545569 177322467 2 1
45+
3 177323733 177920817 3 1
46+
3 177924271 181755151 2 1
47+
3 181757438 183762407 3 1
48+
3 183763646 192156982 2 1
49+
3 192161890 198098659 1 0
50+
4 72156 24552547 2 0
51+
4 24555707 130311790 1 0
52+
4 130315641 130330843 2 0
53+
4 130330870 190035460 1 0
54+
5 44922 14211132 2 2
55+
5 14213026 22066390 2 1
56+
5 22067328 22180749 2 0
57+
5 22183989 25636739 2 2
58+
5 25638420 26789022 3 2
59+
5 26789986 27965921 2 2
60+
5 27971429 32592421 4 2
61+
5 32592630 37171263 4 1
62+
5 37172281 45904860 5 1
63+
5 45905895 46433021 4 1
64+
5 50165632 60547144 1 1
65+
5 60548019 60702474 2 1
66+
5 60702828 79741661 1 1
67+
5 79743372 104043278 1 0
68+
5 104043544 104070979 0 0
69+
5 104072104 181170660 1 0
70+
6 149609 25360786 1 0
71+
6 25360827 32706382 1 1
72+
6 32706500 32708152 2 1
73+
6 32708217 68444781 1 1
74+
6 68445706 68446810 1 0
75+
6 68447263 75297747 1 1
76+
6 75298436 77681439 2 1
77+
6 77683407 81733782 3 1
78+
6 81739760 86530974 1 1
79+
6 86531366 118986644 1 0
80+
6 118990590 136245494 1 1
81+
6 136251173 136442878 1 0
82+
6 136444321 150373723 1 1
83+
6 150373994 150392633 1 0
84+
6 150392646 166157278 1 1
85+
6 166157669 166282518 2 1
86+
6 166282804 170606038 1 1
87+
7 50257 62429682 1 1
88+
7 62520745 62865902 1 0
89+
7 62866394 70555174 1 1
90+
7 70556098 76333852 2 1
91+
7 76343555 90725312 1 1
92+
7 90730935 91197785 2 1
93+
7 91201296 95087634 1 1
94+
7 95090756 97008955 3 1
95+
7 97010441 97198508 6 1
96+
7 97204155 109935841 3 1
97+
7 109935864 110919515 2 1
98+
7 110919691 112396892 1 0
99+
7 112398675 148694665 2 1
100+
7 148697503 148845730 1 1
101+
7 148855364 156807076 2 1
102+
7 156808051 156826136 4 1
103+
7 156827424 159325753 2 1
104+
8 211532 43815067 1 0
105+
8 43821075 43937428 4 0
106+
8 45971464 61571798 1 1
107+
8 61572015 61855513 2 1
108+
8 61861219 99121478 1 1
109+
8 99123903 99143448 1 0
110+
8 99146725 104044816 1 1
111+
8 104045469 127294837 2 1
112+
8 127295360 127806062 3 2
113+
8 127810463 127834189 1 1
114+
8 127835176 128270779 2 1
115+
8 128272105 129059187 3 2
116+
8 129060141 140562779 4 2
117+
8 140563259 140629163 3 2
118+
8 140630283 145074901 4 2
119+
9 57539 1530874 0 0
120+
9 1532253 15647501 1 0
121+
9 15648592 16060419 2 0
122+
9 16060434 22734127 1 0
123+
9 22737083 72569317 1 1
124+
9 72572131 72582687 1 0
125+
9 72584024 74883947 1 1
126+
9 74885405 76078496 2 1
127+
9 76078889 76317777 2 2
128+
9 76319906 77935448 2 1
129+
9 77936015 83694208 1 1
130+
9 83694726 83710135 1 0
131+
9 83710827 85237093 1 1
132+
9 85237668 87661940 3 1
133+
9 87663871 89611257 4 1
134+
9 89613596 89645488 8 1
135+
9 89646949 93367036 6 1
136+
9 93371597 118034446 1 0
137+
9 118035728 125650397 2 0
138+
9 125653227 125813165 4 0
139+
9 125815260 128325296 2 0
140+
9 128347426 130059541 1 0
141+
9 130074996 133910021 2 0
142+
9 133912683 135729307 1 0
143+
9 135729934 138106695 2 0
144+
9 138109082 138181722 0 0
145+
10 48486 31380865 1 0
146+
10 31388277 31872558 1 1
147+
10 31872613 31895348 2 1
148+
10 31897855 33082735 1 1
149+
10 33083001 38280610 1 0
150+
10 38290809 39488839 1 1
151+
10 39490321 39495147 1 0
152+
10 39501995 66115784 1 1
153+
10 66115997 120674655 2 1
154+
10 120676010 120845382 4 1
155+
10 120850879 133621484 2 1
156+
11 199813 17277267 1 0
157+
11 17277312 85828574 1 1
158+
11 85829204 85945131 2 1
159+
11 85945880 91583335 1 1
160+
11 91586410 135075414 1 0
161+
12 79927 8370483 1 1
162+
12 8370629 9780609 2 1
163+
12 9783092 79977033 1 1
164+
12 79981332 80057464 2 1
165+
12 80059561 91388378 1 1
166+
12 91390320 92244918 2 1
167+
12 92247025 100102408 1 1
168+
12 100119182 100177240 1 0
169+
12 100184523 100280148 2 0
170+
12 100303359 133248987 1 0
171+
13 18455821 23995287 1 1
172+
13 23995352 64765321 1 0
173+
13 64771076 64986978 3 0
174+
13 64986990 74770601 4 0
175+
13 74775298 74974049 6 0
176+
13 74974558 95472395 4 0
177+
13 95476304 95876475 5 0
178+
13 95876601 101432474 4 0
179+
13 101432658 106523643 2 0
180+
13 106527004 106557030 1 0
181+
13 106562006 114343518 2 0
182+
14 19784736 21032438 1 1
183+
14 21032890 21080000 2 1
184+
14 21082899 21921098 1 1
185+
14 21921291 22511426 2 1
186+
14 22511778 22673954 1 1
187+
14 22679343 22722052 1 0
188+
14 22724888 44966466 1 1
189+
14 44971614 45267336 1 0
190+
14 45269460 51587176 1 1
191+
14 51587179 51632137 2 1
192+
14 51636474 90526698 1 1
193+
14 90526881 90717761 2 1
194+
14 90719306 103135941 1 1
195+
14 103137232 105340459 2 1
196+
14 105343943 106882543 3 2
197+
15 19790523 19987698 1 1
198+
15 22622114 30057355 1 0
199+
15 32815789 38168675 1 1
200+
15 38171158 38180581 1 0
201+
15 38183825 50735410 1 1
202+
15 50736406 50745197 1 0
203+
15 50747861 59186714 1 1
204+
15 59187067 68946106 1 0
205+
15 68948017 76465006 2 0
206+
15 76467224 88614569 2 1
207+
15 88618029 101888846 3 1
208+
16 34170 2902422 1 0
209+
16 2906175 6104268 1 1
210+
16 6105228 6359371 1 0
211+
16 6360932 89427923 1 1
212+
16 89434622 89478348 1 0
213+
16 89479391 90096867 1 1
214+
17 151035 1349559 1 0
215+
17 1351581 1407289 0 0
216+
17 1409167 2037754 1 0
217+
17 2045307 8701177 2 0
218+
17 8702757 10471881 0 0
219+
17 10474457 18919157 2 0
220+
17 18924480 39600000 2 0
221+
17 39600010 40000000 8 1
222+
17 40000020 83204151 1 0
223+
18 64775 1904305 1 0
224+
18 1906065 1984347 2 0
225+
18 1984420 10909870 1 0
226+
18 10913439 15336266 1 1
227+
18 20969476 23068411 3 1
228+
18 23070048 23736980 5 1
229+
18 23741751 80256731 1 0
230+
19 274479 3447024 2 0
231+
19 3447747 6189061 1 0
232+
19 6194477 18368209 1 1
233+
19 18368237 18393002 2 1
234+
19 18400115 19362221 1 1
235+
19 19362636 23864715 2 1
236+
19 23868518 58533199 1 1
237+
20 68303 18893204 1 1
238+
20 18894144 21994388 1 0
239+
20 21996456 22196220 2 1
240+
20 22197801 23598646 3 1
241+
20 23598889 25026453 3 0
242+
20 25031519 26353739 1 0
243+
20 28917500 33556136 1 1
244+
20 33558831 36101325 1 0
245+
20 36113204 63891113 1 1
246+
20 63892747 64283878 2 1
247+
21 13224688 46681423 1 0
248+
22 15513541 50757736 1 0
249+
X 333053 1928280 1 0
250+
X 1928645 2530323 7 1
251+
X 2530357 2548305 8 1
252+
X 2548306 2768825 7 1
253+
X 2769281 2776765 6 1
254+
X 2777819 2781205 8 1
255+
X 2781514 23840571 1 0
256+
X 23844709 24213641 2 0
257+
X 24216257 77892658 1 0
258+
X 77900292 84041375 2 0
259+
X 84042004 155695384 1 0
260+
X 155705325 155711858 4 0
261+
X 155711910 155808494 2 0

Diff for: ‎examples/T001-BRCA.grch37.vcf.gz

5.89 KB
Binary file not shown.

Diff for: ‎examples/T001-BRCA.grch37.vcf.gz.tbi

6.07 KB
Binary file not shown.

Diff for: ‎examples/T001-BRCA.grch38.vcf.gz

5.87 KB
Binary file not shown.

Diff for: ‎examples/T001-BRCA.grch38.vcf.gz.tbi

6.34 KB
Binary file not shown.

0 commit comments

Comments
 (0)