2021/07/15:
新增对任意尺寸矩形石墨烯片的支持。包含用法的变更，请看使用说明1.1
2021/05/07：
新增对7*x大小石墨烯的支持。
2018/06/27:
新增用于删除多余字母的预处理功能。详见使用说明1.2
pcc计算功能接收四个参数：
-f (prefix)后接文件名前缀，如对于`n-55-4-6-0.pdb - n-55-4-6-25.pdb这些文件，写'-f n-55-4-6-'即可。
-s (size)石墨烯尺寸，接收3、5或10。在2021/07/05之后，支持任意尺寸的矩形石墨烯片，参数-s需要传入这样的一个正整数：石墨烯矩形里
序号3的C原子到序号8的C原子所在的这条矩形边的尺寸，尺寸大小计算方式类似旧版的六碳环个数计，即原来的3/5/7/10这样的数字。而矩形的另一条边不需要传入
-o (output)输出的文件名，如Output，
【※不要写后缀名，后缀名自动txt】
-t (solvent)所计算中心原子在pdb文件中的名字，如N5、CO等。
pcc输出两个文件，两个都是文本文件格式，其中一个是*.csv，可直接用excel打开 记录最后一帧的文件名 和 记录间隙中分子数随时间浮动情况的文件名 由-o参数控制如参数-o Output，则得到两文件：Output.txt和Output.csv
如
$ pcc -f n-55-4-6- -s 5 -o Output -t N5
pcc可以去除第五列的字母，称“预处理”。预处理必须使用两个参数 -pretreatment -f，-print参数可选， 不得使用 -s -o -t参数。
-pretreatment 后不接任何字符，而-f参数则和计算功能中的含义相同，传入文件名前缀。
当选用 -print 参数时，将从屏幕上输出预处理过程中被改动的行。
如命令
$ pcc -pretreatment -f n-55-4-6-
将使工作目录下所有文件名以n-55-4-6-开头的.pdb文件中第五列多余的字母去掉。
完整使用应该先使用命令
$ pcc -pretreatment -f n-55-4-6-
随后
$ pcc -f n-55-4-6- -s 5 -o Output -t N5
added in 2021/05/07:
工作目录/终端所在目录须与*.pdb文件所在目录相同。
因为 -f 后跟的参数必须是 n-a-55-4-10- 样式，不能是 ./n-a-55-4-10- 样式，更不能是 xx/xx/n-a-55-4-10- 样式。
如果 -f 后跟的参数有空格，可用引号包起来：-f "n a 55 4 10 " ，但最好不在文件(夹)名引入空格。
end added in 2021/05/07.
有多种模式，其中-adl应用场景较常见
有时需要把gro文件的第一列的某些残基序号数字加大，比如 1DDR-28DDT 要改成 2DDR-29DDT，如果文件发到windows上用notepad++改，操作实在太繁琐，而且notepad++使用内存有限，文本量大时容易出错。
$ psub -adl FileName.gro 10000 20000 10 OutName.gro
表示把FileName.gro文件从第10000行到20000行的前面数字如 1TOL 改成 11TOL （数字加上10）并将文件输出到OutName
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我如何将pcc的目录添加到Linux环境变量？
修改home/.profile文件，在文件末尾添加如下内容：
export PATH="$PATH:~/simulation/wu-graphene/myapp/for_simulation"
保存退出，此后你可能需要重新登录用户才会使其生效。
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报错权限不够？
$ pcc bash: /home/.../.../for_simulation/pcc: 权限不够
要想将pcc作为一个命令，需要手动将pcc赋予可执行权限
在
/home/.../.../for_simulation/目录下运行如下指令chmod +x pcc
即可完成对pcc添加可执行权限，psub权限不够解决方式相似。
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pcc 报错：
Traceback (most recent call last):
File "pcc", line 484, in <module>
read_data(file_path)
File "pcc", line 140, in read_data
if int(sl[4]) == s:
ValueError: invalid literal for int() with base 10: 'X'
是因为文件里有多余的字母，需要先执行预处理，命令示例：pcc -pretreatment -f n-a-55-4-10-