Skip to content

Commit

Permalink
modified examples
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
schwemro committed Aug 7, 2023
1 parent 92fb0d0 commit f0fb9b4
Show file tree
Hide file tree
Showing 9 changed files with 198 additions and 0 deletions.
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys1_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys1_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys1_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys1 -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys2_bromide_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys2_bromide_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys2_bromide_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys2_bromide -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys2_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys2_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys2_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys2 -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys3_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys3_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys3_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys3 -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys4_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys4_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys4_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys4 -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys8_bromide_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys8_bromide_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys8_bromide_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys8_bromide -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys8_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys8_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys8_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys8 -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys9_bromide_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys9_bromide_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys9_bromide_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys9_bromide -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,22 @@
#!/bin/bash
#SBATCH --time=6:00:00
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --mem=12000
#SBATCH --mail-type=FAIL
#SBATCH [email protected]
#SBATCH --job-name=svat_crop_lys9_mc
#SBATCH --output=svat_crop_lys9_mc.out
#SBATCH --error=svat_crop_lys9_mc_err.out
#SBATCH --export=ALL

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate roger
cd /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/svat_crop_monte_carlo/svat

python svat_crop.py -b numpy -d cpu --lys-experiment lys9 -td "${TMPDIR}"
# Move output from local SSD to global workspace
echo "Move output to /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo"
mkdir -p /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo
mv "${TMPDIR}"/SVATCROP_*.nc /home/fr/fr_fr/fr_rs1092/roger/examples/plot_scale/reckenholz/output/svat_crop_monte_carlo

0 comments on commit f0fb9b4

Please sign in to comment.