3rd try: site partially functional

_quarto.yml

@@ -9,7 +9,7 @@ website:
 
   page-footer:
     right: "Page built with [Quarto](https://quarto.org/) and [NOAA Quarto Simple Template](https://nmfs-opensci.github.io/NOAA-quarto-simple)"
-    left: "© [CC-1.0](content/LICENSE.txt)"
+    left: "© [CC-1.0](LICENSE.txt)"
 
   sidebar:
     background: "#008080"

about.qmd

@@ -0,0 +1,5 @@
+---
+title: "Sobre este site"
+---
+
+Este é um site experimental do Grupo de Ecologia de Ros do Semiárido. A finalidade aqui é puramente didatica, por isso vale destacar que qualquer erro ou problema relacionado ao site pode ser reportado ao responsável. É fundamental que os usuários do site compreendam que plágio e outras formas de má conduta acadêmica são inaceitáveis e podem ter sérias consequências. O responsável pelo site se compromete a remover qualquer conteúdo ofensivo ou sem a devida fonte consultada, que possa ter sido publicado erroneamente ou por engano.

content/about.qmd

@@ -0,0 +1,14 @@
+---
+title: "Sobre este site"
+editor: source
+---
+
+Este é um site experimental do grupo de estudos e pesquisas em Ecologia de Rios do Semiárido (GERSA), que é vinculado ao Laboratório de Ecologia do campus V da Universidade Estadual da Paraíba.
+
+O site é uma plataforma criada com o objetivo de apresentar este grupo de estudos e pesquisas, ao mesmo tempo explorando diferentes conceitos e técnicas utilizados na análise de dados em Ecologia, associados a disciplina de Ecologia Numérica do Curso de Bacharelado em Ciências Biológicas da UEPB.
+
+É importante destacar que os exemplos apresentados no site podem conter imprecisões ou códigos demasiado extensos (aparentemente desnecessários para um ecólogo e programador de R mais experiente), mas isso é proposital, pois a finalidade é oferecer um material didático para os alunos, que possa facilitar a compreensão dos conceitos abordados nas aulas e estudos de Ecologia. Dessa forma, o site é uma ferramenta complementar às aulas presenciais e as pesquisas realizadas pelo grupo, buscando fornecer exemplos práticos e didáticos para estudantes de Ecologia.
+
+Como mencionado, a finalidade é didatica e de apresentar os temas seguindo passo-a-passoa e contextualizando com dados ecológicos reais. Por isso, além das informações sobre o conteúdo do site experimental deste grupo, é importante destacar que qualquer erro ou problema relacionado ao site podem ser reportados ao responsável através do email: [elviomedeiros\@servidor.uepb.edu.br]([email protected])
+
+É fundamental que os usuários do site compreendam que plágio e outras formas de má conduta acadêmica são inaceitáveis e podem ter sérias consequências. O responsável pelo site se compromete a remover qualquer conteúdo ofensivo ou sem a devida fonte consultada, que possa ter sido publicado erroneamente ou por engano.

content/gersa.qmd

@@ -0,0 +1,19 @@
+---
+title: "Grupo de Ecologia de Rios do Semiárido"
+subtitle: "Laboratório de Ecologia - UEPB Campus V"
+page-layout: full
+lang: "pt-br"
+---
+
+# Apresentação
+
+Os rios do trópico semiárido são importantes elementos na dinâmica da paisagem que compõe a Caatinga no nordeste Brasileiro. Estes rios existem na maior parte do tempo como cursos de água secos, com séries de poças temporárias e semipermanentes espalhadas no seu leito.
+
+Nesse contexto, foi formado em 2008 o **Grupo de estudos e pesquisas sobre a Ecologia de Rios do Semiárido** ([GERSA](http://dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/28119)), com o objetivo de estudar a estrutura e o funcionamento desses sistemas e avaliar sua importância para a manutenção da biodiversidade aquática do semiárido Brasileiro (@fig-abrangencia_sa).
+
+![Abrangência do clima semiárido no nordeste Brasileiro e áreas de atuação do Grupo de Ecologia de Rios do Semiárido](abrangencia_sa.png){#fig-abrangencia_sa fig-align="center" width="459"}
+
+# Sobre o GERSA
+
+O Grupo de estudos e pesquisas em Ecologia de Rios do Semiárido, vinculado  ao Laboratório de Ecologia do campus V da UEPB, tem o objetivo de estudar a estrutura e o funcionamento de riachos intermitentes e perenes do trópico semiárido brasileiro e avaliar sua importância para a manutenção e conservação da biodiversidade aquática. Pesquisas desenvolvidas por este grupo levarão a um melhor entendimento da estrutura e do funcionamento de rios intermitentes incluindo os trechos que ocorrem no domínio semiárido e no litoral de clima tropical. Informação gerada permitirá que planos de conservação e manejo considerem os processos ecológicos em rios.
+

content/habs.qmd

@@ -0,0 +1,18 @@
+---
+title: "Tipos de ambiente"
+---
+
+Os principais tipos de ambientes de interesse do GERSA são:
+
+
+## Rios temporários
+
+## Lagoas temporárias
+
+## "Rock pools"
+
+## Fitotelmos
+
+## Poças de chuva
+
+## Açudes

content/index.qmd

@@ -0,0 +1,31 @@
+---
+title: "Laboratório de Ecologia"
+subtitle: "Campus V - UEPB"
+image: _logo7gersa.jpg
+about:
+  template: trestles
+  image-shape: round
+  image-width: 20em
+  links:
+  - text: E-mail
+    icon: envelope
+    href: mailto:[email protected]
+  - text: DGP CNPq
+    icon: bank
+    href: http://dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/28119
+  - text: Ecologia Numérica
+    icon: bar-chart-line-fill
+    href: https://elviomedeiros.quarto.pub
+  - text: Manuscritos
+    icon: layers
+    href: https://elviomedeiros.quarto.pub
+---
+
+# Apresentação
+
+Os rios do trópico semiárido são importantes elementos na dinâmica da paisagem que compõe a Caatinga no nordeste Brasileiro. Estes rios existem na maior parte do tempo como cursos de água secos, com séries de poças temporárias e semipermanentes espalhadas no seu leito.
+
+Nesse contexto, foi criado o **Grupo de estudos e pesquisas sobre a Ecologia de Rios do Semiárido** ([GERSA](http://dgp.cnpq.br/dgp/espelhogrupo/28119)), com o objetivo de estudar a estrutura e o funcionamento desses sistemas e avaliar sua importância para a manutenção da biodiversidade aquática do semiárido Brasileiro (@fig-abrangencia_sa).
+
+![Abrangência do clima semiárido no nordeste Brasileiro e áreas de atuação do Grupo de Ecologia de Rios do Semiárido](abrangencia_sa.png){#fig-abrangencia_sa fig-align="center" width="459"}
+

content/manus.qmd

@@ -0,0 +1,10 @@
+---
+title: "Futuras publicações"
+editor: source
+---
+
+Artigos sendo escritos:
+
+-   Environmental predictors of fish assemblage composition in dryland aquatic systems [Manuscrito](https://rpubs.com/elviomedeiros)
+
+-   Zooplankton as indicator of conservation unit effectiveness [Manuscrito](https://rpubs.com/elviomedeiros)

content/projs.qmd

@@ -0,0 +1,56 @@
+---
+title: "Projetos recentes"
+editor: source
+---
+
+Alguns dos projetos desenvolvidos pelo GERSA/Lab. de Ecologia da UEPB, são:
+
+::: callout-warning
+## Precisando de estagiários. Vagas em aberto: Indicadores da saúde ecológica em riachos de Mata Atlâncitca: Reserva Biológica Guaribas
+:::
+
+# Iniciação Científica
+
+::: callout-tip
+## Avaliação das características morfo- e bio- ecológicas de *Hoplias malabaricus* (Characiformes: Erythrinidae) em decorrência do desenvolvimento de protuberância dermal associada à respiração aquática superficial
+:::
+
+::: callout-tip
+## Estádio de maturação gonadal e conteúdo estomacal de *Hoplias malabaricus* (Characiformes: Erythrinidae) em condições de hipóxia em uma poça temporária de um rio intermitente
+:::
+
+::: callout-tip
+## Avaliação histológica de protuberância dermal associada à respiração aquática superficial em *Hoplias malabaricus* (Bloch 1974) (Characiformes: Erythrinidae)
+:::
+
+# Em andamento
+
+::: callout-tip
+## Desenvolvimento de protuberância dermal associada à respiração aquática superficial em *Hoplias malabaricus* (Characiformes: Erythrinidae) em um rio intermitente.
+:::
+
+# Finalizados
+
+::: callout-tip
+## 2016 - 2018: Avaliação da saúde ecológica da bacia do rio Paraíba: macroinvertebrados bentônicos como ferramenta.
+:::
+
+Descrição: Os padrões ecológicos de composição e estrutura de comunidades e sua quantificação são frequentemente utilizados como os principais indicadores biológicos da saúde de riachos. Contudo, estes padrões fornecem limitada informação sobre importantes processos ecológicos que ocorrem em ecossistemas ribeirinhos (e.g. padrões gerais de diversidade e estabilidade de comunidades). Atualmente, estudos indicam que o estudo dos processos ecológicos em uma escala mais ampla e de cunho holístico são fundamentais para a determinação da saúde de rios. É proposto no presente projeto que três medidas de indicadores biológicos sejam usadas para se avaliar a saúde do ecossistema. Estas medidas seriam (1) a distribuição geral da diversidade e sua partição entre as escalas espaciais; (2) a dinâmica de colonização ao longo do tempo em segmentos diferentes do rio; e (3) resistência e resiliência das comunidades frente a distúrbios. Macrozoobentos foram usados como ferramenta para estes indicadores biológicos.
+
+Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
+
+Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
+
+Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado da Paraiba. Universidade Estadual da Paraíba. Edital PROPESQ/UEPB-2015.
+
+::: callout-tip
+## 2013 - 2016: Estrutura do habitat, composição da fauna e isótopos estáveis como ferramentas na avaliação da saúde ecológica em riachos tropicais.
+:::
+
+Descrição: Os padrões ecológicos de composição e estrutura de comunidades e sua quantificação são freqüentemente utilizados como os principais indicadores biológicos da saúde de riachos. Contudo, estes padrões fornecem limitada informação sobre importantes processos ecológicos que ocorrem em ecossistemas ribeirinhos (e.g. fontes e destino de energia e nutrientes, e dinâmica da cadeia trófica). Atualmente, estudos indicam que o estudo dos processos ecológicos em uma escala mais ampla e de cunho holístico são fundamentais para a determinação da saúde de rios. É proposto no presente projeto que três medidas de indicadores biológicos sejam usadas para se avaliar a saúde do ecossistema. Estas medidas seriam (1) a avaliação da estrutura do habitat disponível para colonizadores; (2) a composição da fauna e suas relações com espécies nativas e introduzidas; e (3) a medição direta da quantidade de carbono orgânico produzido e consumido dentro do sistema e a análise do destino do carbono orgânico produzido na zona ripária e no rio dentro da cadeia trófica aquática, associado ao estudo sobre a composição faunística e estrutura do habitat disponível para consumidores conspícuos (i.e. peixes).
+
+Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
+
+Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) .
+
+Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Edital Produtividade em Pesquisa-PQ-2012 312028/2012-1.

content/pubs.qmd

@@ -0,0 +1,15 @@
+---
+title: "Publicações"
+editor: visual
+---
+
+Algumas publicações importantes:
+
+-   Bet-hedgers commit to the hedge: Zooplankton in ephemeral semiarid wetlands [Ecology](https://doi.org/10.1002/ecy.4014)
+
+-   Life finds a way: Hatching dynamics of zooplankton dormant stages [Journal of Arid Environments ](https://doi.org/10.1016/j.jaridenv.2023.104949)
+
+-   Ecologia de peixes de riachos intermitentes [*Oecologia australis*](https://doi.org/10.4257/oeco.2021.2502.23)
+
+-   Conservation importance of semi-arid streams in north-eastern Brazil [Aquatic Conservation: Mar.Freshw.Ecosyst](https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/aqc.805)
+

docs/LICENSE.txt

@@ -0,0 +1,121 @@
+Creative Commons Legal Code
+
+CC0 1.0 Universal
+
+    CREATIVE COMMONS CORPORATION IS NOT A LAW FIRM AND DOES NOT PROVIDE
+    LEGAL SERVICES. DISTRIBUTION OF THIS DOCUMENT DOES NOT CREATE AN
+    ATTORNEY-CLIENT RELATIONSHIP. CREATIVE COMMONS PROVIDES THIS
+    INFORMATION ON AN "AS-IS" BASIS. CREATIVE COMMONS MAKES NO WARRANTIES
+    REGARDING THE USE OF THIS DOCUMENT OR THE INFORMATION OR WORKS
+    PROVIDED HEREUNDER, AND DISCLAIMS LIABILITY FOR DAMAGES RESULTING FROM
+    THE USE OF THIS DOCUMENT OR THE INFORMATION OR WORKS PROVIDED
+    HEREUNDER.
+
+Statement of Purpose
+
+The laws of most jurisdictions throughout the world automatically confer
+exclusive Copyright and Related Rights (defined below) upon the creator
+and subsequent owner(s) (each and all, an "owner") of an original work of
+authorship and/or a database (each, a "Work").
+
+Certain owners wish to permanently relinquish those rights to a Work for
+the purpose of contributing to a commons of creative, cultural and
+scientific works ("Commons") that the public can reliably and without fear
+of later claims of infringement build upon, modify, incorporate in other
+works, reuse and redistribute as freely as possible in any form whatsoever
+and for any purposes, including without limitation commercial purposes.
+These owners may contribute to the Commons to promote the ideal of a free
+culture and the further production of creative, cultural and scientific
+works, or to gain reputation or greater distribution for their Work in
+part through the use and efforts of others.
+
+For these and/or other purposes and motivations, and without any
+expectation of additional consideration or compensation, the person
+associating CC0 with a Work (the "Affirmer"), to the extent that he or she
+is an owner of Copyright and Related Rights in the Work, voluntarily
+elects to apply CC0 to the Work and publicly distribute the Work under its
+terms, with knowledge of his or her Copyright and Related Rights in the
+Work and the meaning and intended legal effect of CC0 on those rights.
+
+1. Copyright and Related Rights. A Work made available under CC0 may be
+protected by copyright and related or neighboring rights ("Copyright and
+Related Rights"). Copyright and Related Rights include, but are not
+limited to, the following:
+
+  i. the right to reproduce, adapt, distribute, perform, display,
+     communicate, and translate a Work;
+ ii. moral rights retained by the original author(s) and/or performer(s);
+iii. publicity and privacy rights pertaining to a person's image or
+     likeness depicted in a Work;
+ iv. rights protecting against unfair competition in regards to a Work,
+     subject to the limitations in paragraph 4(a), below;
+  v. rights protecting the extraction, dissemination, use and reuse of data
+     in a Work;
+ vi. database rights (such as those arising under Directive 96/9/EC of the
+     European Parliament and of the Council of 11 March 1996 on the legal
+     protection of databases, and under any national implementation
+     thereof, including any amended or successor version of such
+     directive); and
+vii. other similar, equivalent or corresponding rights throughout the
+     world based on applicable law or treaty, and any national
+     implementations thereof.
+
+2. Waiver. To the greatest extent permitted by, but not in contravention
+of, applicable law, Affirmer hereby overtly, fully, permanently,
+irrevocably and unconditionally waives, abandons, and surrenders all of
+Affirmer's Copyright and Related Rights and associated claims and causes
+of action, whether now known or unknown (including existing as well as
+future claims and causes of action), in the Work (i) in all territories
+worldwide, (ii) for the maximum duration provided by applicable law or
+treaty (including future time extensions), (iii) in any current or future
+medium and for any number of copies, and (iv) for any purpose whatsoever,
+including without limitation commercial, advertising or promotional
+purposes (the "Waiver"). Affirmer makes the Waiver for the benefit of each
+member of the public at large and to the detriment of Affirmer's heirs and
+successors, fully intending that such Waiver shall not be subject to
+revocation, rescission, cancellation, termination, or any other legal or
+equitable action to disrupt the quiet enjoyment of the Work by the public
+as contemplated by Affirmer's express Statement of Purpose.
+
+3. Public License Fallback. Should any part of the Waiver for any reason
+be judged legally invalid or ineffective under applicable law, then the
+Waiver shall be preserved to the maximum extent permitted taking into
+account Affirmer's express Statement of Purpose. In addition, to the
+extent the Waiver is so judged Affirmer hereby grants to each affected
+person a royalty-free, non transferable, non sublicensable, non exclusive,
+irrevocable and unconditional license to exercise Affirmer's Copyright and
+Related Rights in the Work (i) in all territories worldwide, (ii) for the
+maximum duration provided by applicable law or treaty (including future
+time extensions), (iii) in any current or future medium and for any number
+of copies, and (iv) for any purpose whatsoever, including without
+limitation commercial, advertising or promotional purposes (the
+"License"). The License shall be deemed effective as of the date CC0 was
+applied by Affirmer to the Work. Should any part of the License for any
+reason be judged legally invalid or ineffective under applicable law, such
+partial invalidity or ineffectiveness shall not invalidate the remainder
+of the License, and in such case Affirmer hereby affirms that he or she
+will not (i) exercise any of his or her remaining Copyright and Related
+Rights in the Work or (ii) assert any associated claims and causes of
+action with respect to the Work, in either case contrary to Affirmer's
+express Statement of Purpose.
+
+4. Limitations and Disclaimers.
+
+ a. No trademark or patent rights held by Affirmer are waived, abandoned,
+    surrendered, licensed or otherwise affected by this document.
+ b. Affirmer offers the Work as-is and makes no representations or
+    warranties of any kind concerning the Work, express, implied,
+    statutory or otherwise, including without limitation warranties of
+    title, merchantability, fitness for a particular purpose, non
+    infringement, or the absence of latent or other defects, accuracy, or
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+ c. Affirmer disclaims responsibility for clearing rights of other persons
+    that may apply to the Work or any use thereof, including without
+    limitation any person's Copyright and Related Rights in the Work.
+    Further, Affirmer disclaims responsibility for obtaining any necessary
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+    Work.
+ d. Affirmer understands and acknowledges that Creative Commons is not a
+    party to this document and has no duty or obligation with respect to
+    this CC0 or use of the Work.