Ya no es necesario usar getOption("recount3_url")

lcolladotor · Jan 31, 2024 · 97074e0 · 97074e0
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diff --git a/04_recount3.R b/04_recount3.R
@@ -4,25 +4,6 @@ library("recount3")
 
 
 ## ----'quick_example'-----------------------------------------------------------------
-## Cambiaremos el URL de recount3 a Amazon (AWS)
-## para evitar problems de TLS versión 1.2 en
-## Windows (luego tiene una versión más vieja).
-
-## Primero vemos el URL actual
-getOption(
-    "recount3_url",
-    "http://duffel.rail.bio/recount3"
-)
-
-## Ahora si lo cambiamos
-options(recount3_url = "https://recount-opendata.s3.amazonaws.com/recount3/release")
-
-## Y vemos que ya funcionó el cambio.
-getOption(
-    "recount3_url",
-    "http://duffel.rail.bio/recount3"
-)
-
 ## Revisemos todos los proyectos con datos de humano en recount3
 human_projects <- available_projects()
 

diff --git a/04_recount3.Rmd b/04_recount3.Rmd
@@ -49,25 +49,6 @@ Después tenemos que identificar un estudio de interes y determinar si queremos
 
 
 ```{r 'quick_example'}
-## Cambiaremos el URL de recount3 a Amazon (AWS)
-## para evitar problems de TLS versión 1.2 en
-## Windows (luego tiene una versión más vieja).
-
-## Primero vemos el URL actual
-getOption(
-    "recount3_url",
-    "http://duffel.rail.bio/recount3"
-)
-
-## Ahora si lo cambiamos
-options(recount3_url = "https://recount-opendata.s3.amazonaws.com/recount3/release")
-
-## Y vemos que ya funcionó el cambio.
-getOption(
-    "recount3_url",
-    "http://duffel.rail.bio/recount3"
-)
-
 ## Revisemos todos los proyectos con datos de humano en recount3
 human_projects <- available_projects()